Η αλλεργική επιπεφυκίτιδα προκαλείται από μη φυσιολογική ανοσοαπόκριση της επιπεφυκίτιδας σε αλλεργιογόνα.
Συνηθισμένα αλλεργιογόνα είναι το τρίχωμα των ζώων, τα ακάρεα της σκόνης, η σκόνη, η γύρη κ.λπ., αλλεργικά άτομα μπορεί να εμφανιστούν μετά από επαφή με φαγούρα στα μάτια, αυξημένες εκκρίσεις, εύκολο να δακρύσουν και ούτω καθεξής.